MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022784	GAT	2	6	504294	504299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_022784	CATT	2	8	504364	504371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_022784	AGGGGA	2	12	504376	504387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_022784	TG	3	6	504413	504418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_022784	CGGC	2	8	504492	504499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_022784	AAG	2	6	504516	504521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_022784	TTG	2	6	504534	504539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_022784	G	7	7	504544	504550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_022784	TAA	2	6	504556	504561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_022784	GAT	2	6	504569	504574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_022784	GTTT	2	8	504592	504599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_022784	ATG	2	6	504636	504641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_022784	GTGG	2	8	504656	504663	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_022784	TCA	2	6	504693	504698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_022784	AGT	2	6	504706	504711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_022784	GAT	2	6	504986	504991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_022784	TCT	2	6	504995	505000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_022784	AGC	2	6	505023	505028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_022784	GCT	2	6	505166	505171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_022784	ATGC	2	8	505231	505238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_022784	GCAA	2	8	505248	505255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_022784	CTAT	2	8	505275	505282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_022784	TAA	2	6	505306	505311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_022784	GT	3	6	505316	505321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_022784	CG	3	6	505360	505365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_022784	ATGA	2	8	505427	505434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_022784	GCC	2	6	505485	505490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_022784	C	6	6	505489	505494	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3529	NC_022784	GAC	2	6	505502	505507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_022784	TG	3	6	505518	505523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_022784	CCA	2	6	505878	505883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_022784	GCA	2	6	505889	505894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_022784	GCA	2	6	505901	505906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_022784	GT	3	6	505908	505913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_022784	CGT	2	6	506335	506340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_022784	ATGC	2	8	506353	506360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_022784	CAA	3	9	506364	506372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_022784	TGC	2	6	506476	506481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_022784	TATT	2	8	506514	506521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_022784	TTG	2	6	506558	506563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_022784	CAG	2	6	506575	506580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_022784	CCTT	2	8	506610	506617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_022784	T	6	6	506820	506825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_022784	CT	4	8	506883	506890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_022784	ATG	2	6	506978	506983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_022784	ATGCT	2	10	506997	507006	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3547	NC_022784	GTG	2	6	507107	507112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_022784	AAT	2	6	507116	507121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_022784	CAA	2	6	507230	507235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_022784	AG	3	6	507554	507559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_022784	GCAA	2	8	507588	507595	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_022784	GTT	2	6	507663	507668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_022784	GGC	2	6	507833	507838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_022784	GAGC	2	8	507880	507887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_022784	GT	3	6	507907	507912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_022784	TG	3	6	507969	507974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_022784	CGCA	2	8	507975	507982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_022784	GTG	2	6	508053	508058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_022784	CAGG	2	8	508078	508085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_022784	TCC	2	6	508097	508102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_022784	TG	3	6	508117	508122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_022784	TGC	3	9	508186	508194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_022784	GGC	2	6	508216	508221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_022784	GAT	2	6	508291	508296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_022784	TG	3	6	508328	508333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_022784	CG	4	8	508347	508354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_022784	TTGCTG	2	12	508364	508375	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3568	NC_022784	GACC	2	8	508404	508411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_022784	CGC	2	6	508412	508417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_022784	TA	4	8	508424	508431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_022784	GTT	2	6	508590	508595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_022784	GCT	2	6	508735	508740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_022784	A	6	6	508769	508774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_022784	AACT	2	8	508819	508826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_022784	TGAA	2	8	508832	508839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_022784	ATG	2	6	508875	508880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_022784	CAC	2	6	508883	508888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_022784	TTA	2	6	508979	508984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_022784	GAT	2	6	509016	509021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_022784	TAA	2	6	509040	509045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_022784	AC	3	6	509095	509100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_022784	GCTGT	2	10	509123	509132	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3583	NC_022784	AAT	2	6	509144	509149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_022784	GCC	2	6	509172	509177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_022784	TGAA	2	8	511052	511059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_022784	ACGT	2	8	511065	511072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_022784	CG	3	6	511073	511078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_022784	ATA	2	6	511088	511093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_022784	TAG	2	6	511134	511139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_022784	AAT	2	6	514416	514421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_022784	TCGG	2	8	514437	514444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_022784	TG	4	8	514457	514464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_022784	CAA	2	6	514478	514483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_022784	ACG	2	6	515442	515447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_022784	GTG	2	6	515489	515494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_022784	GCG	2	6	515535	515540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_022784	CGAT	2	8	515550	515557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_022784	G	6	6	516894	516899	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_022784	AAT	2	6	517028	517033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_022784	GGC	2	6	517073	517078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_022784	CT	4	8	517128	517135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_022784	GGC	2	6	517305	517310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_022784	TGCC	2	8	517701	517708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_022784	ACGG	2	8	517798	517805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_022784	CT	3	6	518714	518719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_022784	TGC	2	6	518804	518809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_022784	CAA	2	6	518840	518845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_022784	GGT	2	6	522654	522659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_022784	TTG	2	6	522674	522679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_022784	AG	3	6	523644	523649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_022784	ATT	3	9	523653	523661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_022784	ATG	2	6	523665	523670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_022784	GCT	2	6	523675	523680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_022784	GCT	2	6	523855	523860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_022784	CACATC	2	12	523881	523892	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_022784	CA	3	6	523902	523907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_022784	GC	3	6	523969	523974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_022784	AC	3	6	523983	523988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_022784	TG	3	6	524018	524023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_022784	CTA	2	6	524060	524065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_022784	AGAA	2	8	524103	524110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_022784	CAA	2	6	524180	524185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_022784	GAT	2	6	524219	524224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_022784	ATCCA	2	10	524265	524274	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3625	NC_022784	CGTG	2	8	524281	524288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3626	NC_022784	AGC	2	6	524295	524300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_022784	N	54	54	524387	524440	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_022784	N	6	6	524515	524520	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_022784	GCG	2	6	524551	524556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_022784	GTA	3	9	524604	524612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_022784	TGA	2	6	524651	524656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_022784	ATA	2	6	524662	524667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_022784	GAA	2	6	524673	524678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_022784	GAA	2	6	524958	524963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_022784	GC	3	6	524964	524969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3636	NC_022784	AT	3	6	525374	525379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_022784	TAT	2	6	525412	525417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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